该项目计划耗资1360亿港元，还有可能给环境带来负面影响，本已饱受批评。

　　问题的关键在于跑道附近的航运受到严格限制。受影响的水域不仅限于香港，还可能延伸到深圳水域，意味着大量货船必须绕道远行，才能抵达赤湾和蛇口等深圳西部的港口。

　　据悉深港两地政府正就相应的解决方案展开协商。但了解协商内情的人士透露，香港政府的初步提议并没有解决长远的海运需求问题，可能导致深圳西部港口竞争力受损。

　　根据本报见到的一份文件，机场管理局提议，将目前跑道周边的海运限制措施扩大到深圳水域，满足第三条跑道的需要。

　　赤湾港和蛇口港的最大股东招商局国际称，这样的限航规定会严重影响龙鼓西水道的使用。